草薙等人将全身义体化的少女押送到陆军501机关进行分析，原来少女是以战后技术为基础的特殊间谍。她担任搜寻稻草人的任务，而稻草人正是袭击了服务器的嫌疑犯。草薙得知了稻草人的真实身份，名为布林达朱尼亚的会计师。为了查出幕后黑手，草薙决定潜入稻草人的Ghost进行调查。