Miko et Bulkhead se rendent en Grèce pour retrouver un Moissonneur d'Energon. Malheureusement, les nouveaux Decepticons Knock Out et Breakdown s'y intéressent également...

Vince, un garçon qui est dans la même école que Jack, le défie à une course. Arcee, au début réticente, finit par accepter et ils remportent l'épreuve. Mais Jack ne se contente pas de cette seule victoire et, malgré lui, risque la vie de plusieurs personnes...

L'esprit de Megatron se trouve dans le corps de Bumblebee et il tente d'en prendre le contrôle pour retrouver son propre corps. Pendant ce temps, Optimus, Arcee et Bulkhead prennent la direction du Pôle Nord pour empêcher Starscream de faire fondre la calotte glacière..

Breakdown se fait capturer par la Mech, qui a l'intention de récolter des données sur son fonctionnement. Contre toute attente, Bulkhead, son plus grand ennemi, le sauve...

Arcee et Bulkhead voient leurs efforts pour arrêter une patrouille Decepticon contrariés par un appareil magnétique...

Le cerveau de Bulkhead est accidentellement colonisé par la formule secrète de l'Energon synthétique, et le malheureux Autobot se transforme en intellectuel, tandis que les Decepticons le pourchassent pour lui soutirer ses secrets...

Ratchet s'injecte une dose d'Energon synthétique. Il devient plus fort et plus rapide mais commence aussi à contredire Optimus et à le désobéir. Ce qui le mène presque à sa perte...

La Terre subit d'énormes raz de marée, des séismes et des bouleversements météorologiques. L'équipe d'Optimus, accompagnée de Megatron, tente d'atteindre le Spark d'Unicron afin de le détruire grâce à la Matrice de Commandement. Pendant ce temps, Ratchet raconte aux enfants l'histoire d'Orion Pax, qui devint plus tard Optimus Prime...

Jack trouve le moyen de rendre la mémoire à Optimus: Avec l'aide de la clé pour Vector Sigma sur Cybertron.

Bumblebee découvre que MECH et Starscream sont responsables de ses malheurs et Ratchet affronte ses démons de son passé Cybertronien (Son échec d'avoir pu convenablement réparé les cordes vocales de Bumblebee après que Mégatron l'ait laissé quasi détruit.).

Arachnid et Starscream tentent de contrôler un guerrier Insecticon apparu sur Terre.